home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Arsenal Files 6 / The Arsenal Files 6 (Arsenal Computer).ISO / health / med9603.zip / M9630297.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-02-27  |  2KB  |  33 lines
  1.        Document 0297
  2.  DOCN  M9630297
  3.  TI    Solution structure of a bovine immunodeficiency virus Tat-TAR
  4.        peptide-RNA complex.
  5.  DT    9603
  6.  AU    Puglisi JD; Chen L; Blanchard S; Frankel AD; Department of Chemistry and
  7.        Biochemistry, University of; California, Santa Cruz 95064, USA.
  8.  SO    Science. 1995 Nov 17;270(5239):1200-3. Unique Identifier : AIDSLINE
  9.        MED/96072972
  10.  AB    The Tat protein of bovine immunodeficiency virus (BIV) binds to its
  11.        target RNA, TAR, and activates transcription. A 14-amino acid
  12.        arginine-rich peptide corresponding to the RNA-binding domain of BIV Tat
  13.        binds specifically to BIV TAR, and biochemical and in vivo experiments
  14.        have identified the amino acids and nucleotides required for binding.
  15.        The solution structure of the RNA-peptide complex has now been
  16.        determined by nuclear magnetic resonance spectroscopy. TAR forms a
  17.        virtually continuous A-form helix with two unstacked bulged nucleotides.
  18.        The peptide adopts a beta-turn conformation and sits in the major groove
  19.        of the RNA. Specific contacts are apparent between critical amino acids
  20.        in the peptide and bases and phosphates in the RNA. The structure is
  21.        consistent with all biochemical data and demonstrates ways in which
  22.        proteins can recognize the major groove of RNA.
  23.  DE    Amino Acid Sequence  Base Composition  Base Sequence  Gene Products,
  24.        tat/*CHEMISTRY/METABOLISM  Hydrogen Bonding  Immunodeficiency Virus,
  25.        Bovine/*CHEMISTRY  Models, Molecular  Molecular Sequence Data  Nuclear
  26.        Magnetic Resonance  Nucleic Acid Conformation  Protein Conformation
  27.        Protein Structure, Secondary  RNA, Viral/*CHEMISTRY/METABOLISM  Support,
  28.        Non-U.S. Gov't  Support, U.S. Gov't, P.H.S.  JOURNAL ARTICLE
  29.  
  30.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  31.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  32.  
  33.